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地鐵類的問題是著名的月經貼。原因在於，多數人只關注自己的城市，導致問題被反反覆復提來提去。
實際上這個問題很有意思，適合於所有城市。
第一：是以地名命名還是以火車站命名？
答：地鐵站的命名，首先考慮的是，服務儘可能多的人口。根據情況選。
與大家所設想的不同，實際上，地鐵站的客流遠遠高於火車站。中國的火車站一天幾萬就是超級大站了，但是對於地鐵來說，很多站入閘都可以達到每日幾萬，十幾萬，換乘更是遠遠高於這個數字。這個周邊住宅區商業區的人流量，遠比去坐火車的人多得多。
即使是深圳火車站這樣的大站，也不過在春運期間突破了十萬人次，平日不過幾萬。樓主所說的深圳東火車站，春運客流一日一萬多，布吉地鐵站一日的客流就達到了五萬，多數不去深圳東站。布吉站巨大的公交換乘，周邊大量的居民區，巨大的換乘，才是這個站的主要任務。
換句話說，如果火車站旁邊的地鐵站，服務周邊居民多於服務火車站的話，命名為所在區域、街道的名字，更有利於居民出行。火車站？附註一個就好了。「我住布吉街，你到布吉車站給我打電話吧~」多順。
（布吉站確實計劃改名，但是原因是覺得「布吉」有「不吉」的意義，這兒講究點風水，不是因為深圳東站更重要。）
其他例子都是這樣的，一看就知道：
羅湖口岸過關的人遠遠多於去深圳火車站，所以叫「羅湖站」（深圳地鐵1號線）
去西直門辦公居住的人遠遠多於去北京北火車站（這個站客流很低），所以叫「西直門站」（北京地鐵2、4、13號線）
到醉白池公園去的當地人遠多於冷清的松江火車站，所以叫「醉白池站」（上海地鐵9號線）
杭州火車站周邊地區被杭州市民稱為城站，照顧居民方便叫法，所以叫「城站站」。
反之，
北京西站、北京站、深圳北站的出入站客流基本以坐火車為主。所以叫「北京西站」、「北京站」、「深圳北站」
第二：後面要不要加「火車站」、「高鐵站」等等三個字？
答：不加是和國際習慣接軌，加是天朝特色。
實際上，在世界上很多國家，大都市的火車都是參與市郊通勤和市內運輸的。但是中國的鐵道部不知道怎麼回事，就是對於大都市通勤鐵路不肯做（基本都是地方在推動）。這導致了我們地鐵在命名的時候，基本把火車站當做一個和機場、港口一樣的長途對外交通樞紐，是不同的兩個站，會習慣加上「XX火車站」之類的，和「XX機場」、「XX港」是一個思路。
但是很多國家，鐵路系統部分也是都市通勤系統，火車站被看成也是和地鐵站類似的地方，這樣地鐵站命名為「XX火車站」就不合適，而是被叫做地鐵「XX」站、國鐵「XX」站，體現是兩個的類似性，可換乘。
深圳、廣州深受香港影響，這方面和國際接軌不奇怪，實際上，深圳北站在地鐵系統內部叫做「深圳北」站。
【本段含有本人判斷，請仔細辨別】
總結一下，深圳東站、深圳站旁邊的地鐵站命名是合理的，關鍵是由於周邊有更重要的對象要服務。為了照顧儘可能多的人。
以上
附註：
北京：
北京北火車站——西直門
上海：
松江火車站——醉白池
廣州：
慶盛高鐵站——慶盛
深圳：
深圳東火車站——布吉
深圳火車站——羅湖
福田高鐵站——福田、市民中心
香港：
紅磡火車站——紅磡
西九龍高鐵站——九龍、柯士甸
台北：
板橋火車站——板橋
南港火車站——南港
