GWAS曼哈頓圖是基因組關聯研究（Genome-Wide Association Study，簡稱GWAS）中常用的數據可視化方式。它是一種用來展示基因與疾病之間關聯的圖表。以下是GWAS曼哈頓圖的特點：
1. 曼哈頓圖的構成
GWAS曼哈頓圖是一個橫軸表示基因組上的位置，縱軸表示關聯程度（通常是-log10 P值）的圖表。圖表中的每個點代表一個基因位點，其顏色或符號表示基因座的關聯強度。
2. 利用顏色或符號標示多個基因
一張曼哈頓圖通常對應一個GWAS實驗，且可能包含數千個基因位點。為了更好地可視化數據，曼哈頓圖會使用不同的顏色或符號來標示不同的基因。這樣可以更清晰地識別出與疾病或特定表型相關的基因區域。
3. 觀察關聯性強的基因簇
曼哈頓圖中，如果多個基因位點在某個區域上靠近，則可能表示該區域中的一簇基因與疾病或表型相關。通過觀察這些基因簇，研究人員可以發現可能存在的共同遺傳因素。這有助於揭示疾病的遺傳機制和生物學路徑。
4. 可視化遺傳相關信息
GWAS曼哈頓圖還可以提供額外的信息，如基因位點的功能註釋、相關基因的轉錄活動等。這樣的可視化方式有助於更全面地理解基因與疾病之間的關聯性。
5. 對比不同疾病或表型的關聯圖
研究人員還可以通過對比不同疾病或表型的曼哈頓圖，尋找共享的遺傳風險位點或遺傳因子。這有助於比較不同疾病之間的遺傳相似性或差異性。
6. 主要用於初步篩選與疾病相關的基因
總的來說，GWAS曼哈頓圖是GWAS研究中的重要工具，可用於初步篩選與疾病或表型相關的基因位點。然後，研究人員可以進一步對這些位點進行驗證和深入研究，了解其在疾病發展過程中的具體作用。
綜上所述，GWAS曼哈頓圖是一種有效的數據可視化方式，可以幫助研究人員在基因組關聯研究中發現與疾病相關的基因位點，並深入探究其在疾病發展過程中的作用。
